第3话：不好！魔方已被开启。
莱杰中尉指挥着潜艇驶向无人小岛。小岛的地形结构很独特，西北侧是一片海拔很高的山，在山体的中间有一条深向海底的谷带直接通向小岛的中心，感觉就像被一把斧子劈开了一样，将山体分成两半儿。潜艇沿着这条谷带继续向小岛内陆行驶，一个大兵说道：“中尉，再前进500米就要搁浅了。”拉杰中尉没有说话，在手上的控制板上点了几下后，看向后方的外星潜艇。大兵继续说道：“300米……200米……100米…50米……”中尉突然喊道：“停！发射！”一声令下，两个导弹向外星潜艇冲了过来，外星潜艇很轻松的躲开，继续向莱杰中尉的潜艇冲了过来。飞过去的两颗导弹划出两道优美的弧线冲向了两侧的山崖，一声巨响，山体被炸裂，大块的石头向下掉落，外星鱼人没有注意到这一切，当发现时也为时已晚，被压在了巨石下。这时，曼哈顿将军派来的战舰过来了，将大石头挪开后，把困在里面的鱼人拖了出来……
在夏威夷群岛东北方向不远的海底，长着一片儿奇特的植物，每个植物都有9米来高，在海里形成一小片儿密集的林子。这些植物围成一个足球场大小的圆圈，而圆圈的中间有两架外星潜艇被植物牢牢困住。
就在5分钟之前：杰斯将军派去的几架装着种子的第3飞行队战机飞向最近的“机器鲨鱼”号潜艇进行支援。战机贴着海面向追赶“机器鲨鱼”号的几个外星潜艇进行攻击。最外侧的2个外星潜艇迅速转弯，向相反方向驶去，最后方的1个外星潜艇也跟着慢了下来，并向后方驶去。只剩2个外星潜艇依然紧咬着“机器鲨鱼”号不放，第3飞行队的3架战机也紧随其后。其他5架战机分别去攻击另外3个外星潜艇，但被其中1个外星潜艇击落下来一架战机，3个外星潜艇开始向“三棱柱”的位置驶去，在附近作战的人类潜艇也赶过来支援。由于外星潜艇迅速向海底下沉，剩下4架战机无法攻击到外星潜艇，在追了一小段后便向“机器鲨鱼”号的方向飞去。
3架战机超过追赶“机器鲨鱼”号的两个外星潜艇，在“机器鲨鱼”号和外星潜艇之间并排飞行。第3飞行队队长罗杰斯发出命令，三架战机同时向海底方向发射6颗装着种子的鱼雷。一秒钟之后，鱼雷的推进装置开始分离，剩下的部分继续向下。又过了一秒钟，鱼雷开始分解，种子也随之露了出来。种子在接触到海水后迅速发芽生长，植物的枝干不是很粗壮，但是很长很软，枝干上的叶子也向海草一样，但比海草要长要宽，六株植物并排生长，迅速结成了一张植物网。驶来了两个外星潜艇没有反映过来，被植物的茎叶缠住。其中一个外星潜艇迅速加大马力挣脱出来，但很快被前面刚刚落下的种子所生长出来的茎叶再次缠住。从后面赶到的4架战机在它们的后方也种下八颗种子。之后，7架战机围成一个圈在海平面盘旋的同时，继续向海里投放种子。两个外星潜艇被围在中间，发动机也被植物的茎叶破坏，两个鱼人也被茎叶缠住晕了过去。5架战机又在圆圈内投放了剩下的种子。这些植物在长到6、7米的时候，生长开始变慢，并带着两个外星潜艇向海底“游去”，根系在接触到海底的沙石后，迅速向下延伸，茎叶也找了2米左右后停止了生长。最终在海底形成一小片儿“巨型海草林子”。
“机器鲨鱼”号潜艇驶向“林子”的上方，将困住两个外星潜艇的枝叶割断，再用铁爪将两个外星潜艇抓住后，驶向杰斯将军的指挥舰。
而在另一个战场上，“振宁号”潜艇在混战中击沉了两个外星潜艇，外星鱼人受了重伤昏迷了过去。在其他潜艇的掩护下，拖着两个外星潜艇驶向陈将军的指挥舰。潜艇舱里，王队长正在向陈将军汇报着：“陈将军，鱼人开始撤退了，它们都在往外星“三棱柱”的方向行驶，我们是否需要追击。”陈将军坐在指挥室里，看着显示屏说道：“不用了，都返回吧，把那两只鱼人带过来。”“是！将军。”
泰勒驾驶的飞机来到了外星“三棱柱”的上方附近后，直接冲向了海里，外星“三棱柱”的门再次打开了，外星潜艇开始陆续返回到“三棱柱”内。来自日本的一支潜艇也向“三棱柱”的大门驶去，但是在靠近大门的时候，潜艇的发动机停止了工作，其他设备也都陆续停止。潜艇开始下沉，一个正在往回行驶的外星小潜艇一炮将其轰烂。大约过了不到15分钟，待外星小潜艇都返回后，“三棱柱”的大门关上了。
在外星“三棱柱”内，泰勒在下飞机前戴上了氧气面罩。“三棱柱”的内部都是海水。两个鱼人来到飞机前，带着泰勒一起前往“三棱柱”的主控室。通过电梯来到60层后，又利用移动平台来到主控室内。
主控室内有30多个大大小小的屏幕，可以通过地球上的卫星、街道上的摄像头、摄影棚里的摄像机等等来观察地球上的一切动向。在这些大屏幕的前面，有一把悬浮在半空中的座椅。座椅是用珊瑚岩制作而成，整体深灰色，在座椅靠背上装饰着一个大宝石，和在圣诞岛上的那位“领袖”雕像头上带的宝石造型一模一样。椅子缓缓转了过来，坐在上面的是这些鱼人的老大，头上戴着一个像皇冠一样的头饰，上面也同样镶着一块造型一样的宝石。
泰勒单膝跪地，头低下说道：“禀报大人，魔方已经拿到。”说着，将手里的箱子递给了左边的鱼人手下。鱼人手下走上台阶，把箱子交给了这个鱼人老大。鱼人老大开打箱子，里面是一个透明的长方形盒子，盒子的四周共有6个指纹识别的凹槽，只有六个人同时解锁才能将盒子打开。在盒子的里面放着一个跟棒球一样大小还发着亮光的正方体，这个正方体就是萨欧德魔方。
鱼人老大将一个芯片样子的东西放在了盒子的正上方，“芯片”在闪了三下红灯后变成了绿灯，同时盒子的盖子打开了。鱼人老大将魔方取出来后，操作着座椅“飘”到了侧面一个圆形仪器旁，把魔方放进了这个仪器的中间，又将头上的宝石取了下来，放到了仪器边上一个形状大小一样的凹槽里。过了几秒钟，仪器里传来“哔”的声音。鱼人老大按下一个按钮……
坐在指挥室里的陈将军把显示屏切换到外星“三棱柱”的画面上。外星“三棱柱”的大门都已关闭，不远的地方还有几艘潜艇的残骸，几个潜艇还在打扫战场，寻找着幸存者。陈将军将画面快退到“三棱柱”的大门刚刚打开的时候，忽然看到一架外形完全不同的“潜艇”出现在画面里。陈将军马上定格了画面，并将那艘“潜艇”放大，看到驾驶舱里的女人是泰勒！继续播放画面，只见泰勒驾驶着“潜艇”进到了“三棱柱”内……陈将军若有所思的想着，小张走了过来，说道：“陈将军，我们截取了一段对话，请您听一下！”陈将军点了点头，小张将一个U盘放到显示屏下的数控版上，扬声器开始放出声音：“大人，东西已经拿到，相信他们很快就会发现了。”另一个声音说道：“直接到方舟这里来，我会派人去接应你。”
陈将军说道：“这个女人的声音像是泰勒的，那个被称作‘大人’的应该是那些鱼人的头儿了，张博士发来的声音文件里也有提到这个‘大人’。方舟……看来那个‘三棱柱’就是它们的方舟啊！小张，把小弓给我叫来……”话还没说完，海面突然开始震动，海浪开始变的汹涌，就在“方舟”的位置，一道白光向上射去，打在空中。“方舟”出来的那个大洞开始往外冒水，就像天上出现了一个巨大的水龙头，开始往地球注水。
位于南极洲的某个地下实验室里，一台巨型计算机的指示灯突然亮了起来，紧接着屏幕也跟着亮起来。在不到1分钟的时间里，从北京的世贸天阶、纽约的时代广场到体育馆、公园再到每家每户的电视、电脑，地球上所以的屏幕都被这个计算机攻占，画面上只有蓝色的底和一行字……
“振宁号”已经驶进指挥舰的后舱，十几个士兵正在将被抓的两只外星鱼人抬进试验舱里。陈将军看着显示屏里的画面，画面里：射向天空的那道白光还没有消失，天上的大洞还在向地球注着水。小张和小弓从指挥室外面一起走了进来。就这这时，指挥室里的屏幕上的画面消失了，变成了蓝色的底，紧接着显示出一行字：“嗨~人类，我又回来了！”陈将军看到这几个字震惊的说道：“不好！魔方已被开启……”